RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 SLC2A1P11166 492 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ADRA2CP18825 462 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF1AP19438 455 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SLC6A9P48067 706 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 MMP16P51512 607 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SLC3A1Q07837 685 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 ZMYND11Q15326 602 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-209ENST00000439106 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF799Q96GE5 643 aa11.66□□□□□ -0.54
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PRAME-209ENST00000439106 H3BN98 237 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-209ENST00000439106 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 COPS4Q9BT78 406 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAME-209ENST00000439106 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.65□□□□□ -0.54
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PRAME-209ENST00000439106 AQP12BA6NM10 295 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 TMEM178BH3BS89 294 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 GNGT2O14610 69 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 SURF4O15260 269 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 ANPEPP15144 967 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-209ENST00000439106 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-209ENST00000439106 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-209ENST00000439106 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-209ENST00000439106 METRNQ9UJH8 293 aa11.64□□□□□ -0.55
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PRAME-209ENST00000439106 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.64□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 A0A0G2JMP0 313 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 A0A0X1KG70 313 aa11.63□□□□□ -0.55
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PRAME-209ENST00000439106 CBX1P83916 185 aa11.63□□□□□ -0.55
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PRAME-209ENST00000439106 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 ST7LQ8TDW4 575 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 SPTSSAQ969W0 71 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 AMELYQ99218 206 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 MMP26Q9NRE1 261 aa11.63□□□□□ -0.55
PRAME-209ENST00000439106 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.63□□□□□ -0.55
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