RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 GLO1Q04760 184 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 NEDD8Q15843 81 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 LINGO2Q7L985 606 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SSX6Q7RTT6 188 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SLC16A9Q7RTY1 509 aa8.65□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.65□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.65□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 FBXO17Q96EF6 278 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-211ENST00000429899 INTS14Q96SY0 518 aa8.65□□□□□ -1.02
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ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PR80 420 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 MYL12BO14950 172 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 SEC14L2O76054 403 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 INMTO95050 263 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 WNT11O96014 354 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 SCG5P05408 212 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 QDPRP09417 244 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 OR2T7P0C7T2 308 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV1-2P23083 117 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 GIFP27352 417 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 ENTPD1P49961 510 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 KCNMB1Q16558 191 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 MEP1BQ16820 701 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 TEX30Q5JUR7 227 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 Q6ZT83 130 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 OR2T27Q8NH04 317 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 MND1Q9BWT6 205 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 POLE4Q9NR33 117 aa8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.64□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 A6NHS1 94 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 ATP6V1E1P36543 226 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 TGFBR2P37173 567 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 OR3A2P47893 321 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 WNT4P56705 351 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 GALEQ14376 348 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 CDONQ4KMG0 1287 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.63□□□□□ -1.03
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ATG4B-211ENST00000429899 OTPQ5XKR4 325 aa8.63□□□□□ -1.03
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