RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PITX2Q99697 317 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 CDADC1Q9BWV3 514 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TMCC3Q9ULS5 477 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 F5H5P2 479 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ARPC2O15144 300 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ATP8B1O43520 1251 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 CD200P41217 278 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 GNB2P62879 340 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 FOXL1Q12952 345 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MALLQ13021 153 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MOGAT3Q86VF5 341 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 UPRTQ96BW1 309 aa17.56■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM246Q9BRR3 403 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 WDR76Q9H967 626 aa17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 F5H5K5 113 aa17.55■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 CD80P33681 288 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 HMGA2P52926 109 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 RAD23AP54725 363 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TPTEP56180 551 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MAB21L1Q13394 359 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PGBD2Q6P3X8 592 aa17.55■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 RAB40AQ8WXH6 277 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A4Q9H015 551 aa17.55■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 KRT36O76013 467 aa17.54■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 PLATP00750 562 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 IRF2P14316 349 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PMELP40967 661 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 DCDC5Q6ZRR9 648 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PGAP1Q75T13 922 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PARP8Q8N3A8 854 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00471Q8N535 108 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR8B3Q8NGG8 313 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR52L1Q8NGH7 329 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR52E2Q8NGJ4 325 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MAP6Q96JE9 813 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR8B2Q96RD0 313 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 DDOQ99489 341 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF747Q9BV97 191 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 FN3KQ9H479 309 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 NDE1Q9NXR1 346 aa17.54■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 CDH10Q9Y6N8 788 aa17.54■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 M0R135 149 aa17.53■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 PHYHO14832 338 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF205O95201 554 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DQA2P01906 255 aa17.53■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DPB1P04440 258 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 SLCO4A1Q96BD0 722 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF799Q96GE5 643 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 CDRT15Q96T59 188 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM15Q9C019 465 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 FAM107BQ9H098 131 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa17.53■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF823P16415 610 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MTNR1AP48039 350 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PITPNBP48739 271 aa17.52■□□□□ 0.4
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LIMS1-208ENST00000428064 C16orf89Q6UX73 402 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 CPLX4Q7Z7G2 160 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 NAA40Q86UY6 237 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PLPP7Q8NBV4 271 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR10S1Q8NGN2 331 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR11L1Q8NGX0 322 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T4Q8NH00 348 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 EGLN3Q9H6Z9 239 aa17.52■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 GMDSO60547 372 aa17.51■□□□□ 0.39
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa17.51■□□□□ 0.39
LIMS1-208ENST00000428064 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
LIMS1-208ENST00000428064 PSMB10P40306 273 aa17.51■□□□□ 0.39
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEA2P43356 314 aa17.51■□□□□ 0.39
LIMS1-208ENST00000428064 NPY4RP50391 375 aa17.51■□□□□ 0.39
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa17.51■□□□□ 0.39
LIMS1-208ENST00000428064 SHISA2Q6UWI4 295 aa17.51■□□□□ 0.39
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