RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HPP00738 406 aa16.54■□□□□ 0.24
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACER2Q5QJU3 275 aa16.51■□□□□ 0.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRC3Q7RTR2 1065 aa16.51■□□□□ 0.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEIOBQ8N635 442 aa16.51■□□□□ 0.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NABP1Q96AH0 204 aa16.51■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDA1Q9BW61 102 aa16.51■□□□□ 0.23
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.51■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC5A6Q9Y289 635 aa16.51■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.5■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNASE1P24855 282 aa16.5■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTSSP25774 331 aa16.5■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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