RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 DCDP81605 110 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SORDQ00796 357 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 RUNX2Q13950 521 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 CST6Q15828 149 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 STK11Q15831 433 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 GPR162Q16538 588 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF74Q16587 644 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 GUCA2BQ16661 112 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 HFEQ30201 348 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 DEFB134Q4QY38 66 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LIPNQ5VXI9 398 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ELP2Q6IA86 826 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM166AQ6J272 317 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LEG1Q6P5S2 330 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 RNF44Q7L0R7 432 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM122BQ7Z309 247 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 NRACQ8N912 160 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 EXD3Q8N9H8 876 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC75AQ8NAA5 344 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR2G2Q8NGZ5 317 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 THAP6Q8TBB0 222 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRHL3Q8TE85 626 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 PIGKQ92643 395 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM106AQ96A25 262 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 C4orf45Q96LM5 186 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 VSTM2LQ96N03 204 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 INTS14Q96SY0 518 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 NMNAT3Q96T66 252 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 PHB2Q99623 299 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 NMES1Q9C002 83 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 XKR8Q9H6D3 395 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 FKRPQ9H9S5 495 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRPV4Q9HBA0 871 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 BEX1Q9HBH7 125 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 MMP26Q9NRE1 261 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM100Q9NV29 134 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 GDE1Q9NZC3 331 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 PRODH2Q9UF12 536 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXL4Q9UKA2 621 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNK6Q9Y257 313 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 PTPRSQ13332 1948 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 EML5Q05BV3 1969 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A0J9YY10 115 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A1W2PPK0 400 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM72A0PK05 275 aa3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.3 ms