RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 LAD1O00515 517 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC16A7O60669 478 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMC2O95347 1197 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACTL6AO96019 429 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RHOCP08134 193 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYL9P24844 172 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPICP45877 212 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 P2RX1P51575 399 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 DGCR6Q14129 220 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RGNQ15493 299 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPTPQ5TA50 214 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUPD1Q68J44 220 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPINK14Q6IE38 97 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARL9Q6T311 187 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC29Q8WV35 223 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 NTAN1Q96AB6 310 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACBD6Q9BR61 282 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 MED4Q9NPJ6 270 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 NKX2-6A6NCS4 301 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 DFFAO00273 331 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CETN3O15182 167 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALOX12BO75342 701 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RDH16O75452 317 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CST4P01036 141 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 GCGP01275 180 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTSLP07711 333 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD3GP09693 182 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD37P11049 281 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARL2P36404 184 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARR3P36575 388 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYCNOSP40205 109 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CXCL5P42830 114 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 HCAR3P49019 387 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRISP3P54108 245 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 PAFAH1B2P68402 229 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST3GAL4Q11206 333 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF266Q14584 549 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 PON2Q15165 354 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 HES5Q5TA89 166 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 METTL21CQ5VZV1 264 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR11H7Q8NGC8 314 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR6K2Q8NGY2 324 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR51A7Q8NH64 312 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDKL2Q92772 493 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RDH5Q92781 318 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPB2Q96IY4 423 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM210BQ96KR6 192 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 TREX1Q9NSU2 369 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A0J9YXV3 536 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SEC14L6B5MCN3 397 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTNSO60931 367 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 SC5DO75845 299 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGKV3-15P01624 115 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 IL12BP29460 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 GNRHRP30968 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNASE1L1P49184 302 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBE2E1P51965 193 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF136P52737 540 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 HCCSP53701 268 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPL31P62899 125 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 KDSRQ06136 332 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSG7Q13046 419 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 STX3Q13277 289 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 GINS1Q14691 196 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNXAQ16473 311 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAL2Q16559 108 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-272P-201ENST00000411028 NDUFAF6Q330K2 333 aa2.99□□□□□ -1.93
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