RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399469.2

HIVEP1-202, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HIVEP1, Length 2,085 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-202ENST00000399469 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 CD163Q86VB7 1156 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ST7LQ8TDW4 575 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 THRSPQ92748 146 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 NABP1Q96AH0 204 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PELI1Q96FA3 418 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 FOXB1Q99853 325 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SIAEQ9HAT2 523 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PALMDQ9NP74 551 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 STUB1Q9UNE7 303 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 CACNG2Q9Y698 323 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF878C9JN71 531 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 H3BMQ9 156 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PLPP2O43688 288 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 WISP2O76076 250 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ABHD16AO95870 558 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 LALBAP00709 142 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 HLA-DPB1P04440 258 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 CD1AP06126 327 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PCBD1P61457 104 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 GUSBP1Q15486 140 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 LIPNQ5VXI9 398 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 GFRALQ6UXV0 394 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 GJC3Q8NFK1 279 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SMIM19Q96E16 107 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 NIPAL2Q9H841 368 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 C5orf51A6NDU8 294 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 OGG1O15527 345 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SPDEFO95238 335 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SERPINA3P01011 423 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 LIPFP07098 398 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 CST2P09228 141 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 H2BFMP0C1H6 154 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 PSKH1P11801 424 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 B4GALT1P15291 398 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 GADD45AP24522 165 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 MPGP29372 298 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 DCTDP32321 178 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 TIMP3P35625 211 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 VAMP2P63027 116 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 TGFBR3Q03167 851 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 DOC2BQ14184 412 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 CDK5R1Q15078 307 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 CTF1Q16619 201 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ARL9Q6T311 187 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 RPTNQ6XPR3 784 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ZNF627Q7L945 461 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 LINGO2Q7L985 606 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SYT9Q86SS6 491 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 AMELYQ99218 206 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.55□□□□□ -1.36
HIVEP1-202ENST00000399469 SSR3Q9UNL2 185 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms