RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HDAC8Q9BY41 377 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 Q9N2J8 555 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 AMBNQ9NP70 447 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ASF1AQ9Y294 204 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ETV7Q9Y603 341 aa6.09□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42P60953 191 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FADS6Q8N9I5 356 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SIGMAR1Q99720 223 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR174Q9BXC1 333 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CIPCQ9C0C6 399 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51I2Q9H344 312 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CA10Q9NS85 328 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GKN3PP0CG01 181 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR6P50406 440 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LCN2P80188 198 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SPIN4Q56A73 249 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB41Q5JT25 222 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CPTPQ5TA50 214 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PELI3Q8N2H9 469 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 LHX4Q969G2 390 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RGMAQ96B86 450 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC115Q96NT0 180 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR22Q99680 433 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NOX3Q9HBY0 568 aa6.09□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 DAPP1Q9UN19 280 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 CSO75390 466 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ABHD16AO95870 558 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR12D1P0DN82 309 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ESDP10768 282 aa6.08□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T2Q6IF00 324 aa6.08□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 MON1BQ7L1V2 547 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T12Q8NG77 320 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ABHD4Q8TB40 342 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 DNASE1L2Q92874 299 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ROPN1LQ96C74 230 aa6.08□□□□□ -1.44
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