RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC30A8Q8IWU4 369 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TBC1D21Q8IYX1 336 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC01561Q8N1V8 128 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COMMD1Q8N668 190 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 WDR31Q8NA23 367 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF738Q8NE65 137 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC26A10Q8NG04 563 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR2Z1Q8NG97 314 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR8K1Q8NGG5 319 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR52M1Q8NGK5 317 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR5B3Q8NH48 314 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR52P1PQ8NH57 321 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR5K2Q8NHB8 316 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AKR7LQ8NHP1 331 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PIFOQ8TCI5 191 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SCGB1C1Q8TD33 95 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DOK4Q8TEW6 326 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CASTOR1Q8WTX7 329 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C15orf40Q8WUR7 153 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BAALCQ8WXS3 180 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GTF2H4Q92759 462 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 YIPF6Q96EC8 236 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DTNBP1Q96EV8 351 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GLT1D1Q96MS3 346 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RNF145Q96MT1 663 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPR82Q96P67 336 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MS4A4EQ96PG1 132 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRIB3Q96RU7 358 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NPY6RQ99463 290 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 APOL4Q9BPW4 351 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC77Q9BR77 488 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SEC22CQ9BRL7 303 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TM2D3Q9BRN9 247 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ERP44Q9BS26 406 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SFXN3Q9BWM7 321 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DUSP21Q9H596 190 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EXO5Q9H790 373 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RHOFQ9HBH0 211 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF160Q9HCG1 818 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR2S2Q9NQN1 319 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RGS18Q9NS28 235 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NMRK1Q9NWW6 199 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HYPKQ9NX55 129 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAB20Q9NX57 234 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CTNNA3Q9UI47 895 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PITPNC1Q9UKF7 332 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HPCAL4Q9UM19 191 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SIGLEC7Q9Y286 467 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACOT9Q9Y305 439 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RLFQ13129 1914 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 THSD7BQ9C0I4 1608 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0G2JLM5 398 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0G2JMP0 313 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0X1KG70 313 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSPAN11A1L157 253 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLAC8L1A1L4L8 177 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GOLGA8OA6NCC3 632 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GMNCA6NCL1 334 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LRCOL1A6NCL2 159 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR5H1A6NKK0 313 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF726A6NNF4 738 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD300LBA8K4G0 201 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GABRR3A8MPY1 467 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 E7EWF7 191 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GOLGA8NF8WBI6 632 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H0YHG0 523 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H7C417 338 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TNFRSF11BO00300 401 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TP53I11O14683 189 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC31A1O15431 190 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GATCO43716 136 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LANCL1O43813 399 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC37A4O43826 429 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD5LO43866 347 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR7C2O60412 319 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDH16O75309 829 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SNNO75324 88 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RP2O75695 350 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GLSO94925 669 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TTC4O95801 387 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CXorf1O96002 111 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MOSP00540 346 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 P01737 135 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HLA-DQB1P01920 261 aa0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms