RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DECR2Q9NUI1 292 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TREM2Q9NZC2 230 aa12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 NAV3Q8IVL0 2385 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC182A6NF36 153 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZAR1LA6NP61 321 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF878C9JN71 531 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PRODHO43272 600 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PRKYO43930 277 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SLC2A1P11166 492 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 LIPAP38571 399 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CRYBB2P43320 205 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SLC6A9P48067 706 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CDK5R2Q13319 367 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 APOFQ13790 326 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SLX4IPQ5VYV7 408 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SPTSSAQ969W0 71 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD6Q9BV23 337 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 YAE1D1Q9NRH1 226 aa12.67□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CD55P08174 381 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 IGFBP5P24593 272 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 RPS7P62081 194 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PPP2R2BQ00005 443 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZMAT1Q5H9K5 638 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35D3Q5M8T2 416 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 AVPI1Q5T686 147 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf73Q69YU5 71 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 BHLHE23Q8NDY6 225 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR2Z1Q8NG97 314 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR10AD1Q8NGE0 317 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR2AE1Q8NHA4 323 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 RNF133Q8WVZ7 376 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ELMOD3Q96FG2 381 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 KCNJ15Q99712 375 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TEX12Q9BXU0 123 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DCAF16Q9NXF7 216 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.66□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 IQCF6A8MYZ5 107 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 H0YL77 283 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 GZMKP49863 264 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CHN2P52757 468 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM33P57088 247 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF92Q03936 586 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TAF13Q15543 124 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 GLYATL3Q5SZD4 288 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CYB5R2Q6BCY4 276 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DRAM2Q6UX65 266 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SHFQ7M4L6 423 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF283Q8N7M2 679 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OR8G5Q8NG78 346 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OTOSQ8NHW6 89 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ITLN1Q8WWA0 313 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DIRC2Q96SL1 478 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.65□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MLNRO43193 412 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 LYNP07948 512 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 OPRL1P41146 370 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 CX3CR1P49238 355 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 HCCSP53701 268 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 GRB2P62993 217 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 EFNB1P98172 346 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 MVKQ03426 396 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 MALLQ13021 153 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP1Q6P2D0 407 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 PGAP1Q75T13 922 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 TCEANCQ8N8B7 351 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 CCL17Q92583 94 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 OR2V2Q96R30 315 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 SLC30A2Q9BRI3 323 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 GABARAPL3Q9BY60 117 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 EGLN1Q9GZT9 426 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 RIBC2Q9H4K1 309 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 WIPI2Q9Y4P8 454 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa12.64□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 A8MV72 311 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 CLDN25C9JDP6 229 aa12.63□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 EI24O14681 340 aa12.63□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 SELEP16581 610 aa12.63□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 HSD11B1P28845 292 aa12.63□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 HFEQ30201 348 aa12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms