RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 HACD4Q5VWC8 232 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 SIAH3Q8IW03 269 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 OR1M1Q8NGA1 313 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 PGAM5Q96HS1 289 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.71■□□□□ 0.11
ACTB-201ENST00000331789 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 DBHP09172 617 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CST2P09228 141 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PATE4P0C8F1 98 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ABOP16442 354 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R20P59543 309 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CLN3Q13286 438 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CAMK2BQ13554 666 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PLET1Q6UQ28 207 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 LYPD6Q86Y78 171 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR52I2Q8NH67 350 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 LDAHQ9H6V9 325 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ORC5O43913 435 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF20P17024 532 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 BDKRB2P30411 391 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SLC6A9P48067 706 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PMP22Q01453 160 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 BCL2A1Q16548 175 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 LYZL4Q96KX0 146 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 FOXB1Q99853 325 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 EXO5Q9H790 373 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CALHM2Q9HA72 323 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa15.7■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 DMXL1Q9Y485 3027 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 A0A0B4J293 547 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SULT1B1O43704 296 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CTAG2O75638 210 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CCL1P22362 96 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 BTCP35070 178 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 GDNFP39905 211 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF774Q6NX45 483 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR5D14Q8NGL3 314 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR13C9Q8NGT0 318 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CHAC2Q8WUX2 184 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ACOT7O00154 380 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 XRCC3O43542 346 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SGCEO43556 437 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 KRT33AO76009 404 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ACTL6AO96019 429 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ARSBP15848 533 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SLC6A1P30531 599 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TPTEP56180 551 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF529Q6P280 563 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 AKAP14Q86UN6 197 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR4D6Q8NGJ1 314 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 UPRTQ96BW1 309 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 GABARAPH6UMI1 98 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SYNGR3O43761 229 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 KDM4BO94953 1096 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF32P17041 273 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RAB3AP20336 220 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 MNDAP41218 407 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RTP5Q14D33 572 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RAB35Q15286 201 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PLA1AQ53H76 456 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 DOK3Q7L591 496 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RNF144BQ7Z419 303 aa15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms