RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 NEIL2Q969S2 332 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 CMBLQ96DG6 245 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 NUS1Q96E22 293 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 REEP6Q96HR9 211 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 DUX3Q96PT4 197 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 RETNQ9HD89 108 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 C1RLQ9NZP8 487 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TCF19Q9Y242 345 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 A0A0B4J2E0 115 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 A0A1B0GX12 115 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 B4DGG1 531 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 MANBAO00462 879 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 P2RX6O15547 441 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 VTNP04004 478 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TMEM225BP0DP42 221 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 AADACP22760 399 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 GRPRP30550 384 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 NTSP30990 170 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 STC1P52823 247 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SLC35B1P78383 322 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 MELKQ14680 651 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 AVPI1Q5T686 147 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 CST9Q5W186 159 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TEX261Q6UWH6 196 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 MYLPFQ96A32 169 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PYCR2Q96C36 320 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 WDR92Q96MX6 357 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 OR7D2Q96RA2 312 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 ATP5SQ99766 215 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 A0A0A6YYD5 115 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 AP4M1O00189 453 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PLPP2O43688 288 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 CTSLP07711 333 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 FAM157BP0CG42 384 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 FOLR2P14207 255 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 EPCAMP16422 314 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TBPP20226 339 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TAC1P20366 129 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 HTR1EP28566 365 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PIGAP37287 484 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 P2RY1P47900 373 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 RAB5CP51148 216 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 UBE2V1Q13404 147 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 OR2F1Q13607 317 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 VGLL4Q14135 290 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TAAR8Q969N4 342 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 C20orf173Q96LM9 149 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 RCHY1Q96PM5 261 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 FCRL5Q96RD9 977 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 NDC1Q9BTX1 674 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 MED9Q9NWA0 146 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 MYH7P12883 1935 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 LMO7DNF2Z398 122 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 ORC5O43913 435 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 ESR1P03372 595 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 TFAP2AP05549 437 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 KIR2DS4P43632 304 aa6.11□□□□□ -1.43
RRN3-202ENST00000327307 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms