RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TSPAN15O95858 294 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PMP2P02689 132 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCINQ13939 588 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GUK1Q16774 197 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR4D6Q8NGJ1 314 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPR132Q9UNW8 380 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CACNA1CQ13936 2221 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEACAM18A8MTB9 384 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFNA10P01566 189 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CXCL10P02778 98 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ROM1Q03395 351 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NKAIN3Q8N8D7 197 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 S100A13Q99584 98 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MPDZO75970 2070 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRCA2P51587 3418 aa20.3■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR10H2O60403 315 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM3AP98173 230 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC9A3R2Q15599 337 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDM8Q8N371 416 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR10C1Q96KK4 312 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTSVO60911 334 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HLA-DQA2P01906 255 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADPRHP54922 357 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CACUL1Q86Y37 369 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR4K15Q8NH41 348 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKR7LQ8NHP1 331 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C5orf66Q9H5L9 145 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 INSL6Q9Y581 213 aa20.29■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UMAD1C9J7I0 102 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXS1O43638 330 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JTBO76095 146 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR9K2Q8NGE7 335 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HHLA2Q9UM44 414 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF264O43296 627 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC35E2P0CK97 266 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 S1PR1P21453 382 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THBS4P35443 961 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD81P60033 236 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR5T3Q8NGG3 340 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MEGF10Q96KG7 1140 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GDE1Q9NZC3 331 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 B9D1Q9UPM9 204 aa20.28■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TERTO14746 1132 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCGNO76038 276 aa20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDUFB7P17568 137 aa20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPS23P62266 143 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEACAM5P06731 702 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPCS3P61009 180 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MIDNQ504T8 468 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR4C3Q8NH37 302 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBP1Q9H171 429 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DOK5Q9P104 306 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MEMO1Q9Y316 297 aa20.27■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 S100A10P60903 97 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD55Q3KP44 614 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OTPQ5XKR4 325 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VSTM2LQ96N03 204 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0C4DFX4 3053 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPARCP09486 303 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNB3P16520 340 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC26A5P58743 744 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OPN5Q6U736 354 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C8orf44Q96CB5 159 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCGB3A2Q96PL1 93 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.26■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEC14L6B5MCN3 397 aa20.25■□□□□ 0.83
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF217O75362 1048 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms