RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 GLRA1P23415 457 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 KIR3DL2P43630 455 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 NPSR1Q6W5P4 371 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SULF2Q8IWU5 870 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR4D6Q8NGJ1 314 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SFXN1Q9H9B4 322 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TBX21Q9UL17 535 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 AMDHD2Q9Y303 409 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 MMP24Q9Y5R2 645 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 H0YIG0 161 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 J3QRE1 110 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ERGP11308 486 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CCINQ13939 588 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 NCMAPQ5T1S8 102 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SGPP2Q8IWX5 399 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PRSS35Q8N3Z0 413 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC18Q8N456 261 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CLEC1AQ8NC01 280 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM104Q8NE00 496 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR51F2Q8NH61 342 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ASB17Q8WXJ9 295 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TGIF2Q9GZN2 237 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CNTD2Q9H8S5 307 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SDHAF3Q9NRP4 125 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 UQCC1Q9NVA1 299 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PR64 198 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PRV1 198 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 UPK3AO75631 287 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SEMA4FO95754 770 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM196Q5HYL7 178 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 VOPP1Q96AW1 172 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR5B2Q96R09 309 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 MENTQ9BUN1 341 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 RAB22AQ9UL26 194 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 RNF215Q9Y6U7 377 aa13□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 GBF1Q92538 1859 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LILRB3O75022 631 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CDAP32320 146 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 C9orf152Q5JTZ5 239 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf140Q5VVS0 124 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 IL23AQ9NPF7 189 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LHX6Q9UPM6 363 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 WDSUB1Q8N9V3 476 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM229BQ8NBD8 167 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SLC22A8Q8TCC7 542 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PP11 408 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CYR61O00622 381 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PTGFRP43088 359 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 GFERP55789 205 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SLC22A24Q8N4F4 322 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM217Q8N7C4 229 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 NICN1Q9BSH3 213 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF304Q9HCX3 659 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 KLK13Q9UKR3 277 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 A6NLC8 198 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LY86O95711 162 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 FCGR2CP31995 323 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TAS2R31P59538 309 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 C4orf17Q53FE4 359 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LPCAT3Q6P1A2 487 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SARGQ9BW04 601 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TNFSF18Q9UNG2 199 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 HLA-DOBP13765 273 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SLC26A5P58743 744 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TLE1Q04724 770 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PDCD1Q15116 288 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 BRICD5Q6PL45 260 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR52N5Q8NH56 324 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ASH2LQ9UBL3 628 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 NPTNQ9Y639 398 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ESPL1Q14674 2120 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 GNRHRP30968 328 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 EGR3Q06889 387 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PJVKQ0ZLH3 352 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LINC01590Q5TEZ4 76 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF595Q8IYB9 648 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 GPX8Q8TED1 209 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM234Q8WY98 164 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CLCC1Q96S66 551 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms