RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 OR56B4Q8NH76 319 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 FRZBQ92765 325 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SARAFQ96BY9 339 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 FAM210AQ96ND0 272 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 OR2M2Q96R28 347 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 NUDT19A8MXV4 375 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 BIDP55957 195 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 FAPQ12884 760 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 MAB21L1Q13394 359 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PNV4 684 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 HMX3A6NHT5 357 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 DDOSTP39656 456 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ETV1P50549 477 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TAS2R31P59538 309 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1CAP62136 330 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TP53I3Q53FA7 332 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 OR5AS1Q8N127 324 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 EXD3Q8N9H8 876 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 UPRTQ96BW1 309 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CTDSPLO15194 276 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 FSTP19883 344 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 MLF1P58340 268 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SSX1Q16384 188 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TSSK4Q6SA08 328 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PELI1Q96FA3 418 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 LIPT2A6NK58 231 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 FAM183AA6NL82 134 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 EPPINO95925 133 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TGM1P22735 817 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 KCNMB1Q16558 191 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CNIH2Q6PI25 160 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM106AQ96A25 262 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SPIN2AQ99865 258 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TCFL5Q9UL49 500 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 R4GMQ9 66 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CTDSP2O14595 271 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 BET1O15155 118 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CPT2P23786 658 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CRYBB2P43320 205 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PTH2RP49190 550 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 THBS3P49746 956 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 BRICD5Q6PL45 260 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 DVL2O14641 736 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ECI1P42126 302 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CD226Q15762 336 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CSRP2Q16527 193 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 DRAM2Q6UX65 266 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 PTP4A1Q93096 173 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM72A0PK05 275 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SLC17A2O00624 439 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 YIF1AO95070 293 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ABHD16AO95870 558 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-9P01782 118 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 CXADRP78310 365 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ACER2Q5QJU3 275 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB124Q8NES8 71 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPN3-201ENST00000262539 HGDQ93099 445 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms