RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 RAB28P51157 221 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H2BDP58876 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H2BCP62807 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SPOCK1Q08629 439 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HOGA1Q86XE5 327 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 RSC1A1Q92681 617 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PMM1Q92871 262 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 MUCL1Q96DR8 90 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 POM121Q96HA1 1249 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 AMELYQ99218 206 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 FBXL17Q9UF56 701 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.48□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ARID1AO14497 2285 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF727A8MUV8 499 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 K7EPK0 472 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SPINT1O43278 529 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SFTPBP07988 381 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CPMP14384 443 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ELNP15502 786 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PI3P19957 117 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GDI1P31150 447 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 IGFALSP35858 605 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GRK6P43250 576 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 RABIFP47224 123 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CAMLGP49069 296 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 NPY4RP50391 375 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CTXN1P60606 82 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 FAM3AP98173 230 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ERV3-1Q14264 604 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 UBE2V2Q15819 145 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 INTS14Q96SY0 518 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 STACQ99469 402 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GDE1Q9NZC3 331 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 LAMA1P25391 3075 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 WIPF3A6NGB9 483 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 LDLRAD4O15165 306 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 F13BP05160 661 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SPARCP09486 303 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 G0S2P27469 103 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 FCGR2CP31995 323 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 DNASE1L1P49184 302 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 HSD11B2P80365 405 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 NHLH2Q02577 135 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GPR18Q14330 331 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 MESTQ5EB52 335 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 FHL5Q5TD97 284 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OTPQ5XKR4 325 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OPN5Q6U736 354 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 POC1AQ8NBT0 407 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM104Q8NE00 496 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 OR4K15Q8NH41 348 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 TERB2Q8NHR7 220 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 ASB5Q8WWX0 329 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 RELTQ969Z4 430 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 GNRHR2Q96P88 292 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CREBZFQ9NS37 354 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 LUZP4Q9P127 313 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 MEMO1Q9Y316 297 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.47□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 MPDZO75970 2070 aa6.46□□□□□ -1.37
CSDE1-201ENST00000261443 A0A087WUJ7 227 aa6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms