RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 PRAF2O60831 178 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 NEURL1O76050 574 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CSF1P09603 554 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 RAB3AP20336 220 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 SELENOPP49908 381 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 MAB21L1Q13394 359 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 PGAP1Q75T13 922 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 DOK3Q7L591 496 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC54Q8NEL0 328 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FAM122AQ96E09 287 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FAM210AQ96ND0 272 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 MCUBQ9NWR8 336 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 TRAPPC6AO75865 159 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 PRKXP51817 358 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 GSG1Q2KHT4 349 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FAM27BQ5VT28 67 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CD276Q5ZPR3 534 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 RNF170Q96K19 258 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 DMRTB1Q96MA1 342 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ATG5Q9H1Y0 275 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 MED28Q9H204 178 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 SCPEP1Q9HB40 452 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 DOK2O60496 412 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 LMX1BO60663 402 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF20P17024 532 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 STOMP27105 288 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 PRSS3P35030 304 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 GNALP38405 381 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 PIP4P1Q86T03 277 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 OR2M7Q8NG81 312 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 OR10D3Q8NH80 312 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 TRAV18A0A075B6X5 111 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 PEX14O75381 377 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 SCGNO76038 276 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 BPNT1O95861 308 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 IGLV3-1P01715 115 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 C1QBP02746 253 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 HPNP05981 417 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CD82P27701 267 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ERP29P30040 261 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 SPINK14Q6IE38 97 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 RAB12Q6IQ22 244 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 BIVMQ86UB2 503 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 RAB22AQ9UL26 194 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 PINLYPA6NC86 204 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CXCL13O43927 109 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 GMDSO60547 372 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CAPSLQ8WWF8 208 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 OR51J1Q9H342 316 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CEP250Q9BV73 2442 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 A0A0U1RQV5 110 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CYTIPO60759 359 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ITGA3P26006 1051 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ACTBP60709 375 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 ACTG1P63261 375 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CSRP2Q16527 193 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 GPX8Q8TED1 209 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 GPR84Q9NQS5 396 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 RGS13O14921 159 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 KDM4BO94953 1096 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 MECP2P51608 486 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 Q6ZSR3 168 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 OR4D6Q8NGJ1 314 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 BEX2Q9BXY8 128 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 CNTD2Q9H8S5 307 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD9-201ENST00000249499 FAM172BPA6NC97 362 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 TGM6O95932 706 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD9-201ENST00000249499 ALDOBP05062 364 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms