RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 DEFB108AA8MXU0 73 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF879B4DU55 563 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PIN1P1O15428 100 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 HPGDSO60760 199 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RAMP1O60894 148 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MPZL1O95297 269 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 IGHG1P01857 330 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KLK2P20151 261 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RAB3BP20337 219 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR10A3P58181 314 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OTPQ5XKR4 325 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR52N5Q8NH56 324 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR5AK2Q8NH90 309 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RNF128Q8TEB7 428 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ABHD3Q8WU67 409 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C4orf45Q96LM5 186 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DERL3Q96Q80 235 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RBP7Q96R05 134 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FOXC2Q99958 501 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ELOVL3Q9HB03 270 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NDRG3Q9UGV2 375 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ROS1P08922 2347 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FABP12A6NFH5 140 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM212A6NML5 194 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF43P17038 809 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 AGTR1P30556 359 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 EVX1P49640 407 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CCR9P51686 369 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CEP78Q5JTW2 689 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 IDNKQ5T6J7 187 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LRRN1Q6UXK5 716 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GPAT4Q86UL3 456 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SP140LQ9H930 580 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NOX4Q9NPH5 578 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GJE1A6NN92 205 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NOTOA8MTQ0 251 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C16orf97H3BN30 126 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DNPH1O43598 174 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF432O94892 652 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SYNGR4O95473 234 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF823P16415 610 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 HIST3H3Q16695 136 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 Q499Y3 187 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CNIH2Q6PI25 160 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GDPD1Q8N9F7 314 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ST7LQ8TDW4 575 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PPK0 400 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF254O75437 659 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 VAMP5O95183 116 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 THBDP07204 575 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ENPP1P22413 925 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LOXP28300 417 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KIR3DL2P43630 455 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CLRN1P58418 232 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CAMK2DQ13557 499 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RIN1Q13671 783 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 STAC2Q6ZMT1 411 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C12orf49Q9H741 205 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 POLE4Q9NR33 117 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GOSR1O95249 250 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PTTG1O95997 202 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 WNT11O96014 354 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SRMP19623 302 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CRYGSP22914 178 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DNASE1P24855 282 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RIDAP52758 137 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 WDR38Q5JTN6 314 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KRT77Q7Z794 578 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXC6-201ENST00000243108 POC5Q8NA72 575 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms