RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SPRNQ5BIV9 151 aa18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 THEM6Q8WUY1 208 aa18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 EME1Q96AY2 570 aa18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MSL2Q9HCI7 577 aa18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 LILRA1O75019 489 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CSF3P09919 207 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A1P11166 492 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 PRSS12P56730 875 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 GRB2P62993 217 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CCL8P80075 99 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 CDK5R2Q13319 367 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 RCN1Q15293 331 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 OR2T2Q6IF00 324 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SNX33Q8WV41 574 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 YIPF5Q969M3 257 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ADGRL4Q9HBW9 690 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ZNF319Q9P2F9 582 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.96■□□□□ 0.63
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A31A6NKX4 558 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SPRY3O43610 288 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 GIFP27352 417 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LIPAP38571 399 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC15A1P46059 708 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CDC42P60953 191 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ZNF92Q03936 586 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 RIN1Q13671 783 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 TAF13Q15543 124 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 PCGF3Q3KNV8 242 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A30Q5SVS4 291 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LCN1P1Q5VSP4 162 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 FAM81AQ8TBF8 368 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CYSLTR2Q9NS75 346 aa18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ERICH4A6NGS2 130 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 NDUFS8O00217 210 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 RP2O75695 350 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A16P16260 332 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 GABRB1P18505 474 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A9P48067 706 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CX3CR1P49238 355 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP1-1Q07627 177 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 GLYATL3Q5SZD4 288 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LPCAT4Q643R3 524 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LRRN1Q6UXK5 716 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 GID4Q8IVV7 300 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 OR5AS1Q8N127 324 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 RFLNBQ8N5W9 214 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ZNF283Q8N7M2 679 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 OR2AE1Q8NHA4 323 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 AASSQ9UDR5 926 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 TLN2Q9Y4G6 2542 aa18.94■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GWJ7 208 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 PLSCR5A0PG75 271 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 IQCF6A8MYZ5 107 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CD55P08174 381 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SBK2P0C263 348 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 HTR1FP30939 366 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 NR4A2P43354 598 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 FAM209AQ5JX71 171 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 USP51Q70EK9 711 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 OR8G5Q8NG78 346 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 RDH5Q92781 318 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SPSB4Q96A44 273 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 FAM118AQ9NWS6 357 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LAMP5Q9UJQ1 280 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa18.93■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ABCA1O95477 2261 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A6O15403 523 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 MT-ND5P03915 603 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 H2BFMP0C1H6 154 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ROM1Q03395 351 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CARTPTQ16568 116 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LRRC36Q1X8D7 754 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SGK3Q96BR1 496 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 BPESC1Q9GZL8 116 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LRP12Q9Y561 859 aa18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 PSMD9O00233 223 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD6O75354 484 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms