RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 SFT2D2O95562 160 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FHITP49789 147 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF529Q6P280 563 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OTOSQ8NHW6 89 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 RELTQ969Z4 430 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FBXO7Q9Y3I1 522 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR1A2Q9Y585 309 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HEATR5AQ86XA9 2040 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF726A6NNF4 738 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TSTD3H0UI37 97 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CMPK1P30085 196 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 LRRC75AQ8NAA5 344 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 POC1AQ8NBT0 407 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TMEM104Q8NE00 496 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR5T3Q8NGG3 340 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR13C9Q8NGT0 318 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR8B4Q96RC9 309 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 KCNJ16Q9NPI9 418 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 GRHPRQ9UBQ7 328 aa19■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SOD3P08294 240 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 PET100P0DJ07 73 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CEBPBP17676 345 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF674Q2M3X9 581 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 C14orf28Q4W4Y0 310 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST2H3AQ71DI3 136 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 NEU1Q99519 415 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 B9D1Q9UPM9 204 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HLA-DQA2P01906 255 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CST5P28325 142 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 KHDC3LQ587J8 217 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 C2orf50Q96LR7 162 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 GNRHR2Q96P88 292 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TSPAN32Q96QS1 320 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 S100A13Q99584 98 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIF3AQ9Y2N7 669 aa18.99■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SEC14L6B5MCN3 397 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 GDI1P31150 447 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 THBS4P35443 961 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SLC26A5P58743 744 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 RAB1AP62820 205 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SPEM2Q0P670 501 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FDX2Q6P4F2 183 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF679Q8IYX0 411 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR2I1PQ8NGU4 316 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR4K15Q8NH41 348 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 C2orf88Q9BSF0 95 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GWJ7 208 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TCAPO15273 167 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 B3GALT2O43825 422 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 NKX2-2O95096 273 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TIMP1P01033 207 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SFTPBP07988 381 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 MESP2Q0VG99 397 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 MGAT2Q10469 447 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF610Q8N9Z0 462 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TERB2Q8NHR7 220 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 PMM1Q92871 262 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SOX7Q9BT81 388 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FANCMQ8IYD8 2048 aa18.98■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GV50 99 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF727A8MUV8 499 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 LMX1BO60663 402 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 IFNA10P01566 189 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 RPL12P30050 165 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 DNASE1L1P49184 302 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 VEGFBP49765 207 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 PSG6Q00889 435 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 NTNG2Q96CW9 530 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 MUCL1Q96DR8 90 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 GALNT14Q96FL9 552 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SERINC2Q96SA4 455 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 UBQLN4Q9NRR5 601 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 GPR132Q9UNW8 380 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BKO60814 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 JTBO76095 146 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BJP06899 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BOP23527 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FCGR2CP31995 323 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BBP33778 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BDP58876 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BCP62807 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF74Q16587 644 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST2H2BEQ16778 126 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms