RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GTH9	108 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	GFY	I3L273	518 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CD1C	P29017	333 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	HTR5A	P47898	357 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF85	Q03923	595 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CDK3	Q00526	305 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MEP1B	Q16820	701 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF596	Q8TC21	504 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LHX9	Q9NQ69	397 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CLDND1	Q9NY35	253 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PSME4	Q14997	1843 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PGA4	P0DJD7	388 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM33	P57088	247 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PAX5	Q02548	391 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF266	Q14584	549 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	HPN	P05981	417 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	COX5B	P10606	129 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ADCYAP1	P18509	176 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MSR1	P21757	451 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DIO1	P49895	249 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LCN9	Q8WX39	176 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	UCK1	Q9HA47	277 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MYOT	Q9UBF9	498 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GWA3	101 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MASP2	O00187	686 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	C1QL1	O75973	258 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TRGC1	P0CF51	173 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PPM1A	P35813	382 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC6A9	P48067	706 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	NAAA	Q02083	359 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	LMAN2	Q12907	356 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	IL36A	Q9UHA7	158 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TMPRSS11D	O60235	418 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SP3	Q02447	781 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SGCG	Q13326	291 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF74	Q16587	644 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	YIPF1	Q9Y548	306 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-231	ENST00000639895	MYO9B	Q13459	2157 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CARD18	P57730	90 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	STARD6	P59095	220 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PRPS1	P60891	318 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	DIO2	Q92813	273 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PRRX2	Q99811	253 aa		10.27	□□□□□ -0.77

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