RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637594.1

CLN8-214, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN8, Length 406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-214ENST00000637594 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.33□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.33□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 A0A1W2PRQ8 180 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 F5H5P2 479 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 J3KTA2 159 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 P2RY10O00398 339 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 IMPA2O14732 288 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 MRASO14807 208 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 NDUFA2O43678 99 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 NDUFB2O95178 105 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ZNF205O95201 554 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 PPP1R3DO95685 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CRYBA1P05813 215 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 DBHP09172 617 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 MMP9P14780 707 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 OMGP23515 440 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 FPR3P25089 353 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CRABP1P29762 137 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CD200P41217 278 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 PITPNBP48739 271 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 RAD23AP54725 363 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 FGF12P61328 243 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 RELBQ01201 579 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 COX10Q12887 443 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 DGCR6Q14129 220 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 MAPRE2Q15555 327 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 GPR157Q5UAW9 335 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CBLL1Q75N03 491 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 RRM2BQ7LG56 351 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 OR5AS1Q8N127 324 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ZNF570Q96NI8 536 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SLC22A4Q9H015 551 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 NUAK2Q9H093 628 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SYT4Q9H2B2 425 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SAR1AQ9NR31 198 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CMTM6Q9NX76 183 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CLN8Q9UBY8 286 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.32□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ZNF879B4DU55 563 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 C22orf46C9J442 243 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 M0QZ24 198 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 TIMM23O14925 209 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SLC22A2O15244 555 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 GMDSO60547 372 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 KRT34O76011 436 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CLPXO76031 633 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 MELTFP08582 738 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ACSM4P0C7M7 580 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 IRF2P14316 349 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CFHR2P36980 270 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 OMPP47874 163 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 RAG2P55895 527 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 FXYD6P3P58550 94 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ECH1Q13011 328 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLN8-214ENST00000637594 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 PDCD1Q15116 288 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 KCNJ8Q15842 424 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 IFI44LQ53G44 452 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 DYRK2Q92630 601 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 CHIAQ9BZP6 476 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 MMP27Q9H306 513 aa7.31□□□□□ -1.24
CLN8-214ENST00000637594 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.31□□□□□ -1.24
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