RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SNX33	Q8WV41	574 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ARSG	Q96EG1	525 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR6C76	A6NM76	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IFNA10	P01566	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC2A1	P11166	492 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ADH7	P40394	386 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PRKX	P51817	358 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AKR1C2	P52895	323 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AKR1C1	Q04828	323 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	THRSP	Q92748	146 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	UTS2	O95399	124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF883	P0CG24	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FGF5	P12034	268 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CBR1	P16152	277 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AVPR2	P30518	371 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GLP1R	P43220	463 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GRK6	P43250	576 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	HTR5A	P47898	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LTB	Q06643	244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TAF13	Q15543	124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TP53I3	Q53FA7	332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IDS	B3KWA1	339 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SCD	O00767	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TXNL1	O43396	289 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC34A2	O95436	690 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CD2	P06729	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CD14	P08571	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	HPGD	P15428	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MAK	P20794	623 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ITPKB	P27987	946 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FOXL2	P58012	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IL11RA	Q14626	422 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LIPN	Q5VXI9	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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