RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 METTL15A6NJ78 407 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 J3QLW9 94 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 M0R135 149 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ABCD4O14678 606 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF254O75437 659 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SULT1C4O75897 302 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TNFAIP8O95379 198 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ABHD16AO95870 558 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CRYAAP02489 173 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MT-ND2P03891 347 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CD3EP07766 207 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TACSTD2P09758 323 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF35P13682 527 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 COX6B1P14854 86 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF19P17023 458 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PTAFRP25105 342 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CALCRP30988 508 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SLC6A9P48067 706 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CX3CR1P49238 355 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-211ENST00000626236 OR12D2P58182 307 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ROM1Q03395 351 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 HGFACQ04756 655 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 BEX5Q5H9J7 111 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ACBD4Q8NC06 268 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF799Q96GE5 643 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RADILQ96JH8 1075 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 C4orf36Q96KX1 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 C4orf45Q96LM5 186 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-211ENST00000626236 KCNJ15Q99712 375 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF649Q9BS31 505 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OR51B6Q9H340 312 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 BRD7Q9NPI1 651 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-211ENST00000626236 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-211ENST00000626236 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.36□□□□□ -1.23
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SGMS1-211ENST00000626236 MT-ND5P03915 603 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LCATP04180 440 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 HTR1AP08908 422 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ACSM4P0C7M7 580 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 FAM157BP0CG42 384 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A1P11166 492 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 COL8A1P27658 744 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PSMB10P40306 273 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 WNT5AP41221 380 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MAP2K4P45985 399 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NR1H2P55055 460 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 CDH15P55291 814 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RELBQ01201 579 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LIPNQ5VXI9 398 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 RNLSQ5VYX0 342 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF773Q6PK81 442 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ARL9Q6T311 187 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A25Q6T423 547 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 DRAM2Q6UX65 266 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NAA40Q86UY6 237 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SYS1Q8N2H4 156 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 ABHD4Q8TB40 342 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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