RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 IL5RAQ01344 420 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 GALK2Q01415 458 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 EGR3Q06889 387 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 C6orf52Q5T4I8 152 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ARL9Q6T311 187 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 FBXW12Q6X9E4 464 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 THAP5Q7Z6K1 395 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF679Q8IYX0 411 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 RFLNBQ8N5W9 214 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 OR51G2Q8NGK0 314 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 OR2T27Q8NH04 317 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CNIH3Q8TBE1 160 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SPTSSAQ969W0 71 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MBD6Q96DN6 1003 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 LGALS12Q96DT0 336 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 RNFT2Q96EX2 444 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 C4orf45Q96LM5 186 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 OR8B4Q96RC9 309 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 DOK1Q99704 481 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNJ15Q99712 375 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 COPS4Q9BT78 406 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 PLK3Q9H4B4 646 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 INPP5EQ9NRR6 644 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 AASSQ9UDR5 926 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 POU2F3Q9UKI9 436 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 LRP12Q9Y561 859 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 IRGMA1A4Y4 181 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ACOD1A6NK06 481 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 B9A039 149 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 H7C417 338 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SULT1C4O75897 302 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ATE1O95260 518 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 NGFP01138 241 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CD8AP01732 235 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SOD3P08294 240 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CD53P19397 219 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 THBS4P35443 961 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MMP16P51512 607 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 TPTEP56180 551 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 PPP1CBP62140 327 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CDK5R2Q13319 367 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SNCBQ16143 134 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MST1LQ2TV78 715 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 AGAP6Q5VW22 663 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 KRT80Q6KB66 452 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MUC15Q8N387 334 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC7A6Q92536 515 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ITFG2Q969R8 447 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SPSB4Q96A44 273 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF649Q9BS31 505 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 OPA3Q9H6K4 179 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CMAHPQ9Y471 501 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 F8P00451 2351 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ACANP16112 2415 aa6.99□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 29.5
EFTUD2-221ENST00000591856 A0A1B0GWJ7 208 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 TMEM129A0AVI4 362 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 IGHV3-13P01766 116 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 ADH4P08319 380 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 H2BFMP0C1H6 154 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 OR4A8P0C604 315 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC159P0C7I6 412 aa6.98□□□□□ -1.29
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM157BP0CG42 384 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms