RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH7Q9H992 704 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NRIP3Q9NQ35 241 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SAR1AQ9NR31 198 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GID8Q9NWU2 228 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CMTM6Q9NX76 183 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CLN8Q9UBY8 286 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR1DQ9Y2S0 133 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CMYA5Q8N3K9 4069 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GWJ7 208 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 C22orf46C9J442 243 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SOCS2O14508 198 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF682O95780 498 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 RAG2P55895 527 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPRE2Q15555 327 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNMB1Q16558 191 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 OCLNQ16625 522 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 MEP1BQ16820 701 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 IFI44LQ53G44 452 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF841Q6ZN19 808 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf87Q8N0U7 546 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC7Q9Y286 467 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 LHFPL6Q9Y693 200 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GUS0 222 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PTP4A3O75365 173 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFB2O95178 105 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H3AP68431 136 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 39.8
CAPNS1-211ENST00000590874 MAB21L1Q13394 359 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR157Q5UAW9 335 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR139Q6DWJ6 353 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6YL49 198 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf107Q6ZR85 190 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 DCDC5Q6ZRR9 648 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H3AQ71DI3 136 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4F5Q8NH21 305 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ7Q99807 217 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CHIAQ9BZP6 476 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NDEL1Q9GZM8 345 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HDHD2Q9H0R4 259 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 BEX1Q9HBH7 125 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM100Q9NV29 134 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 C1RLQ9NZP8 487 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TGP01266 2768 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 PHYHO14832 338 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FPR3P25089 353 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 GATA4P43694 442 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 FXYD6P3P58550 94 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 CORO6Q6QEF8 472 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A13Q8TCU3 470 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 HSH2DQ96JZ2 352 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TSSK2Q96PF2 358 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGBPQ9NV56 204 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM5Q9Y2B1 443 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-211ENST00000590874 DCTN6O00399 190 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYBA1P05813 215 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 SFTPBP07988 381 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 OLFML2AQ68BL7 652 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 COLCA1Q6ZS62 124 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CBLL1Q75N03 491 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 RRM2BQ7LG56 351 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCK1Q86TW2 530 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 GJC3Q8NFK1 279 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8TCH9 128 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 RCN3Q96D15 328 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CITED1Q99966 193 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 PCGF1Q9BSM1 259 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD19PQ9H560 264 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 NOX4Q9NPH5 578 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCR6O00574 342 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 ENSAO43768 121 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM20BO75063 409 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF2P14316 349 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB10P40306 273 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPAP49450 140 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD23AP54725 363 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP9P1Q75LS8 142 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC15A3Q8IY34 581 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 HCAR1Q9BXC0 346 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSZQ9UBR2 303 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA7O95182 113 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA1P01009 418 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-211ENST00000590874 MELTFP08582 738 aa21.3■■□□□ 1
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