RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	EBF4	Q9BQW3	602 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	NDUFA2	O43678	99 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	FUT4	P22083	530 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ST3GAL3	Q11203	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	FHL1	Q13642	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864		H7C1C5	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM20B	O75063	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	DBH	P09172	617 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TGFBR2	P37173	567 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	GZMM	P51124	257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	RAD23A	P54725	363 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	LCN6	P62502	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	COX10	Q12887	443 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	OAF	Q86UD1	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	LGALS8	O00214	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	XKRY	O14609	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	RER1	O15258	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	GPR37	O15354	613 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CD200	P41217	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	OR1E2	P47887	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ARF6	P62330	175 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	EGR3	Q06889	387 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ANGPT2	O15123	496 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ADAM20	O43506	726 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	IFNA14	P01570	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CTLA4	P16410	223 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	IFNA8	P32881	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC9A3	P48764	834 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	LOXL3	P58215	753 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	NFYC	Q13952	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	MPPED2	Q15777	294 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864		Q6ZTK2	550 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	CD14	P08571	375 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	FBP1	P09467	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	HIST1H3A	P68431	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	PRKCD	Q05655	676 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	MEST	Q5EB52	335 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	NRM	Q8IXM6	262 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TNNI3-208	ENST00000589864		Q96M85	177 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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