RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580799.2

GGA3-210, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-210ENST00000580799 Q6YL49 198 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 RRM2BQ7LG56 351 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 GJC3Q8NFK1 279 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 Q8TCH9 128 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 COQ7Q99807 217 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CITED1Q99966 193 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CHIAQ9BZP6 476 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SYT4Q9H2B2 425 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 MMP27Q9H306 513 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 RERGLQ9H628 205 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TMEM100Q9NV29 134 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 RHCGQ9UBD6 479 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 H0YL77 283 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 J3KTA2 159 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 P2RY10O00398 339 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 NDUFB2O95178 105 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 DBHP09172 617 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 FUT4P22083 530 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 KLF10Q13118 480 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 KCNJ8Q15842 424 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 BRICD5Q6PL45 260 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CCT8L2Q96SF2 557 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 NUAK2Q9H093 628 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 MARCH7Q9H992 704 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 C1RLQ9NZP8 487 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 NOTCH1P46531 2555 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 ZNF879B4DU55 563 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 ZNF682O95780 498 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 MELTFP08582 738 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CRABP1P29762 137 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 RELBQ01201 579 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 COX10Q12887 443 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 ECH1Q13011 328 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 MALLQ13021 153 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 MAB21L1Q13394 359 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 IFI44LQ53G44 452 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 FAM201AQ5SY85 155 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 DYRK2Q92630 601 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TRIM15Q9C019 465 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SLC22A4Q9H015 551 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 C22orf46C9J442 243 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 SOCS2O14508 198 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 NDUFA2O43678 99 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 FAM20BO75063 409 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 PTP4A3O75365 173 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TOX4O94842 621 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TXNDC12O95881 172 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 HLA-DPB1P04440 258 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CFHR2P36980 270 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 PMELP40967 661 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 CD200P41217 278 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 RPS6KA3P51812 740 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-210ENST00000580799 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms