RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCNG2Q9UJ96 466 aa20.35■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 J3QLI3 93 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCNB2O95067 398 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AVPP01185 164 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HLA-DQA2P01906 255 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCGB2A2Q13296 93 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR5AS1Q8N127 324 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR13G1Q8NGZ3 307 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PITX2Q99697 317 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATF6BQ99941 703 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa20.34■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SBK2P0C263 348 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ACSM4P0C7M7 580 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 T-ENOLP0DO92 83 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GATA3P23771 443 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MS4A2Q01362 244 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 A0A0A6YYJ9 748 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IQCF6A8MYZ5 107 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 F5H5K5 113 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF823P16415 610 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM155Q4W5P6 130 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DCAF12L2Q5VW00 463 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LNX2Q8N448 690 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SPICQ8N5J4 248 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CYB561A3Q8NBI2 242 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR2T4Q8NH00 348 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR2T29Q8NH02 315 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ST7LQ8TDW4 575 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAP6Q96JE9 813 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OCEL1Q9H607 264 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GCM1Q9NP62 436 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 VNN3Q9NY84 501 aa20.32■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LOC105371242A0A075B767 164 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 A0A1B0GWJ7 208 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SELEP16581 610 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PYCR1P32322 319 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BTG1P62324 171 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MICAQ29983 383 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 OR10AD1Q8NGE0 317 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HCAR1Q9BXC0 346 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 REEP1Q9H902 201 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WDR76Q9H967 626 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHB10Q9UN67 800 aa20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPIAL4EA0A075B759 164 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPIAL4DF5H284 164 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IFNL4K9M1U5 179 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FOXH1O75593 365 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPIAL4FP0DN26 164 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MMP16P51512 607 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LCN2P80188 198 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZMYND11Q15326 602 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NAA40Q86UY6 237 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KLHL36Q8N4N3 616 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ASB9Q96DX5 294 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MEGF10Q96KG7 1140 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C1orf21Q9H246 121 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 U3KQV3 271 aa20.3■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 H0YL77 283 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM178BH3BS89 294 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MLNRO43193 412 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SRP9P49458 86 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TPTEP56180 551 aa20.29■□□□□ 0.84
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms