RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 KLBQ86Z14 1044 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.84□□□□□ -1.31
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 F5H5P2 479 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 H0YL77 283 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IMPA2O14732 288 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SASH3O75995 380 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GPANK1O95872 356 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IRF2P14316 349 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NCK1P16333 377 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 FPR3P25089 353 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OMPP47874 163 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ERFP50548 548 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SMIM11AP58511 58 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 BPIFB3P59826 476 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HIST1H3AP68431 136 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SLC36A3Q495N2 470 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GLYATQ6IB77 296 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CGB2Q6NT52 195 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 LEG1Q6P5S2 330 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 C16orf87Q6PH81 154 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PARP8Q8N3A8 854 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ZNF511Q8NB15 262 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR52J3Q8NH60 311 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ERGIC1Q969X5 290 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR8B2Q96RD0 313 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PITX2Q99697 317 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 COQ7Q99807 217 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 B9D1Q9UPM9 204 aa6.83□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 DYSFO75923 2080 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 F5H5K5 113 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 RENP00797 406 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 HLA-DPB1P04440 258 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CRYBA1P05813 215 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NOS3P29474 1203 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PMELP40967 661 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PITPNBP48739 271 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NUDT2P50583 147 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PAX2Q02962 417 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 COX10Q12887 443 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MALLQ13021 153 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SEC23BQ15437 767 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 MEP1BQ16820 701 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 RFX4Q33E94 735 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ZNF404Q494X3 552 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CORO6Q6QEF8 472 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 PGAP1Q75T13 922 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 OR6V1Q8N148 313 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 UPRTQ96BW1 309 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 C7orf34Q96L11 122 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 TSSK2Q96PF2 358 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 NMNAT3Q96T66 252 aa6.82□□□□□ -1.32
COCH-211ENST00000557065 ATF6BQ99941 703 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms