RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.54□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 TMEM230Q96A57 120 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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