RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 FAM168AQ92567 244 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 COQ7Q99807 217 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 CDH20Q9HBT6 801 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 CA10Q9NS85 328 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 TMEM129A0AVI4 362 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 H7C417 338 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 ENTPD6O75354 484 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 UCP2P55851 309 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 ADIPOQQ15848 244 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 OCLNQ16625 522 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 ZNF544Q6NX49 715 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 ZNF101Q8IZC7 436 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 OR6N2Q8NGY6 317 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.96■□□□□ 0.15
PUF60-218ENST00000531995 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.96■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CLIC3O95833 236 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 NGFP01138 241 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 FAM157BP0CG42 384 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SLC25A16P16260 332 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CCNOP22674 350 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 HTR1FP30939 366 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 GLRXP35754 106 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 DSCR9P59020 149 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ERVS71-1P61550 626 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 RPS7P62081 194 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 VHLLQ6RSH7 139 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 NAA40Q86UY6 237 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 GID4Q8IVV7 300 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 OTOSQ8NHW6 89 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 C10orf105Q8TEF2 133 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SLAMF6Q96DU3 332 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 C4orf45Q96LM5 186 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ABHD6Q9BV23 337 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 HDHD2Q9H0R4 259 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 FAM157CP0CG43 387 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ALOX5APP20292 161 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ANOS1P23352 680 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 TMEM255AQ5JRV8 349 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ZNF691Q5VV52 312 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SHFQ7M4L6 423 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 LRP11Q86VZ4 500 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 RNF133Q8WVZ7 376 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 APH1BQ8WW43 257 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 OR51B6Q9H340 312 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 POFUT1Q9H488 388 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 COPS3Q9UNS2 423 aa15.94■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 PRR32B1ATL7 298 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 OR4A8P0C604 315 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ACSM4P0C7M7 580 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 IL17RELQ6ZVW7 336 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ATF6BQ99941 703 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ADI1Q9BV57 179 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 STARD10Q9Y365 291 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.93■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 H0YJX3 145 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 GNAO1P09471 354 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SBK2P0C263 348 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 SERPINF1P36955 418 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CAPGP40121 348 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 RAD52P43351 418 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 EFNA4P52798 201 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 AQP4P55087 323 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ISL1P61371 349 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 GALK2Q01415 458 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 ECH1Q13011 328 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 CARTPTQ16568 116 aa15.92■□□□□ 0.14
PUF60-218ENST00000531995 TTC23Q5W5X9 447 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms