RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 TNFSF13O75888 250 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 TOXO94900 526 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 IL2RAP01589 272 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 TIMP3P35625 211 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 MAGEB1P43366 347 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SOX2P48431 317 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 Q6ZT83 130 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 TPRA1Q86W33 373 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.54□□□□□ -0.08
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PACS1-209ENST00000529757 MMP27Q9H306 513 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 RNF121Q9H920 327 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 HHLA2Q9UM44 414 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.53□□□□□ -0.08
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PACS1-209ENST00000529757 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 M0R135 149 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SLC19A2O60779 497 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 TTRP02766 147 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SLC2A1P11166 492 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 CRYGSP22914 178 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 HTR5AP47898 357 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 TGFBR3Q03167 851 aa14.53□□□□□ -0.08
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PACS1-209ENST00000529757 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 ZNF799Q96GE5 643 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.53□□□□□ -0.08
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PACS1-209ENST00000529757 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 GTF3C1Q12789 2109 aa14.53□□□□□ -0.08
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PACS1-209ENST00000529757 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SMIM30A4D0T7 59 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 H3BSH0 61 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 P2RY10O00398 339 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 PIN1P1O15428 100 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 HLA-HP01893 362 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 RAF1P04049 648 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 ACSM4P0C7M7 580 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 EDN3P14138 238 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 ARR3P36575 388 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SLC6A9P48067 706 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.52□□□□□ -0.08
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PACS1-209ENST00000529757 FAM57BQ71RH2 274 aa14.52□□□□□ -0.08
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PACS1-209ENST00000529757 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SLC7A6Q92536 515 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 TMEM106AQ96A25 262 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 STARD4Q96DR4 205 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 DHDHQ9UQ10 334 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-209ENST00000529757 TTLL8A6PVC2 850 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 NCR1O76036 304 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 UBL3O95164 117 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 DBHP09172 617 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CD79AP11912 226 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 IGHV1-2P23083 117 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PAX7P23759 505 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TPTEP56180 551 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CAV3P56539 151 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 DRAM2Q6UX65 266 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 LUZP2Q86TE4 346 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 PGAM5Q96HS1 289 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 A0A075B6Q4 140 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CGAP01215 116 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 CD2P06729 351 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 GLI4P10075 376 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SRMP19623 302 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 NAXEQ8NCW5 288 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ASB5Q8WWX0 329 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 ORAI1Q96D31 301 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-209ENST00000529757 SLITRK2Q9H156 845 aa14.51□□□□□ -0.09
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