RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 LIMS3P0CW19 117 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 LIMS4P0CW20 117 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 EPXP11678 715 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 CRYGSP22914 178 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 OPRL1P41146 370 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 EGR3Q06889 387 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 PIGFQ07326 219 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ECH1Q13011 328 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 IRF3Q14653 427 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ZNF774Q6NX45 483 aa14.58□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 DOK2O60496 412 aa14.57□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.57□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 MED18Q9BUE0 208 aa14.57□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.57□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.56□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 TRIM64BA6NI03 449 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 PTGES3LE9PB15 166 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 RGS10O43665 173 aa14.56□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 SYS1Q8N2H4 156 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 TBX5Q99593 518 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 NIPAL2Q9H841 368 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.56□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.55□□□□□ -0.08
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PACS1-208ENST00000529677 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 CRLF1O75462 422 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 MT-ND2P03891 347 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 CELA3BP08861 270 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 CECR9P0C854 216 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 HTR5AP47898 357 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ACTA2P62736 377 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ACTG2P63267 376 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 OR52N1Q8NH53 320 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 LINC01560Q8TB33 94 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 Q96MF0 132 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 ALG8Q9BVK2 526 aa14.55□□□□□ -0.08
PACS1-208ENST00000529677 NGBQ9NPG2 151 aa14.55□□□□□ -0.08
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