RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF747Q9BV97 191 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 WDR76Q9H967 626 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 B9D1Q9UPM9 204 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 F5H5P2 479 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SELEP16581 610 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PRSS12P56730 875 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PAX2Q02962 417 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 COX10Q12887 443 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 LEG1Q6P5S2 330 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 MOGAT3Q86VF5 341 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 KLBQ86Z14 1044 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 OR6V1Q8N148 313 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 NMNAT3Q96T66 252 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 FUZQ9BT04 418 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 MIOXQ9UGB7 285 aa14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DPB1P04440 258 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PMELP40967 661 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 GNB2P62879 340 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 KRT72Q14CN4 511 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 RFX4Q33E94 735 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 FAM201AQ5SY85 155 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PARP8Q8N3A8 854 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 RNF148Q8N7C7 305 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 OR4K13Q8NH42 304 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 FANK1Q8TC84 345 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 OR52D1Q9H346 318 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 TMEM100Q9NV29 134 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 V9GYQ6 96 aa14.16□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 LRRC30A6NM36 301 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 F5H5K5 113 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 TMPRSS2O15393 492 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 RENP00797 406 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 CPT2P23786 658 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A6P31641 620 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 NAA40Q86UY6 237 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PITX2Q99697 317 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ADA2Q9NZK5 511 aa14.15□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GWJ7 208 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ARPC3O15145 178 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 GMNNO75496 209 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ACSM4P0C7M7 580 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 FPR3P25089 353 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 ZNF404Q494X3 552 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A28Q96A46 364 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 UPRTQ96BW1 309 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 IFT27Q9BW83 186 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.14□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 OR6C68A6NDL8 312 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 CLDN34H7C241 214 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 GADD45GO95257 159 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 FSTL3O95633 263 aa14.13□□□□□ -0.15
HERC3-211ENST00000513325 LCATP04180 440 aa14.13□□□□□ -0.15
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