RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510576.6

CLMAT3-201, colorectal liver metastasis associated transcript 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLMAT3, Length 1,973 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMAT3-201ENST00000510576 CLDN6P56747 220 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CLDN17P56750 224 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 KCNMB1Q16558 191 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RAET1LQ5VY80 246 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TMEM156Q8N614 296 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR8S1Q8NH09 359 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.7□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TNFRSF10AO00220 468 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RLN1P04808 185 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 FCER2P06734 321 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF20P17024 532 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR10K2Q6IF99 312 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CHIAQ9BZP6 476 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 HPF1Q9NWY4 346 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RAB22AQ9UL26 194 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 UBE2QL1A1L167 161 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RAB3AP20336 220 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PRKXP51817 358 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PER3P56645 1201 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 MLF1P58340 268 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 COMMD2Q86X83 199 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GNRHR2Q96P88 292 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PROK2Q9HC23 129 aa14.69□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 G3V3Y1 287 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 IGHEP01854 428 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RAB12Q6IQ22 244 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RADILQ96JH8 1075 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CA10Q9NS85 328 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GLTPQ9NZD2 209 aa14.68□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 A0A1B0GTI1 187 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 B4E171 279 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 G3V3Q6 166 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TOXO94900 526 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RAB3DO95716 219 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 BPNT1O95861 308 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 TSPAN7P41732 249 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CSNK1A1P48729 337 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GNG2P59768 71 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 H3F3AP84243 136 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ACBD4Q8NC06 268 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 NKD1Q969G9 470 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 FAM46BQ96A09 425 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 NTNG2Q96CW9 530 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 UPB1Q9UBR1 384 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 MED12Q93074 2177 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 OR2M5A3KFT3 312 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RER1O15258 196 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CYB5AP00167 134 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GP1BAP07359 652 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CX3CR1P49238 355 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF81P51508 661 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 RAP2BP61225 183 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CSRP2Q16527 193 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ZNF529Q6P280 563 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 CDH26Q8IXH8 852 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 EXO5Q9H790 373 aa14.67□□□□□ -0.06
CLMAT3-201ENST00000510576 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms