RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TG	P01266	2768 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1W2PRG6	482 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		H0YL77	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CXCR6	O00574	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SPRY3	O43610	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KRT34	O76011	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DIRAS1	O95057	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR6A2	O95222	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF682	O95780	498 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LCK	P06239	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	COX4I1	P13073	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	EGR1	P18146	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HNF1A	P20823	631 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KITLG	P21583	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MSR1	P21757	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PMEL	P40967	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC9A3	P48764	834 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF81	P51508	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF84	P51523	738 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM33	P57088	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CTXN1	P60606	82 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP1CB	P62140	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	GALK2	Q01415	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CD47	Q08722	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MEP1B	Q16820	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1W2PPL8	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368		H3BSA7	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNAB3	O43448	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DOK2	O60496	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LY86	O95711	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TXNDC12	O95881	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SERPINA1	P01009	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	NPPA	P01160	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CD14	P08571	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	COX5B	P10606	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF12	P17014	697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CCNO	P22674	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	APLNR	P35414	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	RAD23A	P54725	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LCN2	P80188	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HSF2	Q03933	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TRAM2	Q15035	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	TAF11	Q15544	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SGCA	Q16586	387 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBE3C-208	ENST00000497368	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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