RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 BHLHE40O14503 412 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 AVPP01185 164 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ACSM4P0C7M7 580 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ZNF823P16415 610 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PYCR1P32322 319 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 GGT2P36268 569 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 ECH1Q13011 328 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 LCN8Q6JVE9 175 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 SPICQ8N5J4 248 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 WDR76Q9H967 626 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.59□□□□□ -0.07
APTX-232ENST00000495360 A0A0A6YYJ9 748 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 GASTP01350 101 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 EPHA1P21709 976 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 CALB2P22676 271 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 GATA3P23771 443 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 MMP16P51512 607 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 BTG1P62324 171 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 OR2T4Q8NH00 348 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 REEP1Q9H902 201 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 VNN3Q9NY84 501 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 IL20Q9NYY1 176 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 U3KQV3 271 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 CUBNO60494 3623 aa14.58□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 TVP23AA6NH52 213 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 H0YL77 283 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 FOXH1O75593 365 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 FAM107AO95990 144 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 SELEP16581 610 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 ADRA2CP18825 462 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 PRSS12P56730 875 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 ZMYND11Q15326 602 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 OR2T29Q8NH02 315 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 MAP6Q96JE9 813 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 GCM1Q9NP62 436 aa14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 TMEM178BH3BS89 294 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 MLNRO43193 412 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 VENTXO95231 258 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 LCATP04180 440 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 TPTEP56180 551 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 MS4A2Q01362 244 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 MALLQ13021 153 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 NAA40Q86UY6 237 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 OR51L1Q8NGJ5 315 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 DDOQ99489 341 aa14.56□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.55□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 F5H5P2 479 aa14.55□□□□□ -0.08
APTX-232ENST00000495360 IFNL4K9M1U5 179 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms