RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR56B4Q8NH76 319 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGXQ8TBF5 258 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF14Q92956 283 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 STARD10Q9Y365 291 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WUU8 490 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GWA3 101 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 A8MWP6 167 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10H3O60404 316 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 THY1P04216 161 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CELA2AP08217 269 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PNMTP11086 282 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 BMP7P18075 431 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PGCP20142 388 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 AHCYP23526 432 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GIFP27352 417 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GDNFP39905 211 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 P2RX1P51575 399 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GAS1P54826 345 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DLX5P56178 289 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXW4P57775 412 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF117Q03924 483 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CBFBQ13951 182 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GAMTQ14353 236 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C1QL4Q86Z23 238 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5W2Q8NH69 310 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GRHL3Q8TE85 626 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 THAP4Q8WY91 577 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NTNG2Q96CW9 530 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL6Q9H0F7 186 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TUBA4BQ9H853 241 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TREM1Q9NP99 234 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2M5A3KFT3 312 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NPSP0C0P6 89 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OSMP13725 252 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 LIFP15018 202 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MNDAP41218 407 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SOX3P41225 446 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RRADP55042 308 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CTBP2P56545 445 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 Q0VFX4 171 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPAN31Q12999 210 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MARCH3Q86UD3 253 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM239Q8WW34 195 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2FQ969M7 185 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXO17Q96EF6 278 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C14orf79Q96F83 325 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SGCZQ96LD1 299 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf34Q96MH7 638 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 KCTD7Q96MP8 289 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TEAD3Q99594 435 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 MRI1Q9BV20 369 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CNIH4Q9P003 139 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.48□□□□□ -1.37
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