RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 OR2M5A3KFT3 312 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 LRRC30A6NM36 301 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF732B4DXR9 585 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SELENOFO60613 162 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 WDR1O75083 606 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 UTS2O95399 124 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 AREGP15514 252 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 THBS4P35443 961 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PPOXP50336 477 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 DUSP8Q13202 625 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 GSG1Q2KHT4 349 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PKDCCQ504Y2 493 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 THEM4Q5T1C6 240 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 TRNP1Q6NT89 227 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 LCN15Q6UWW0 184 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 Q6ZSR9 355 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 LRP11Q86VZ4 500 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PRR22Q8IZ63 422 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SH2D1BO14796 132 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 GP1BAP07359 652 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SLC10A3P09131 477 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF17P17021 662 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 GABRA4P48169 554 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 RUNX2Q13950 521 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 HTR3DQ70Z44 454 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF383Q8NA42 475 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SMIM12Q96EX1 92 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 GINS3Q9BRX5 216 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PARP11Q9NR21 331 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SLC6A1P30531 599 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 GJA4P35212 333 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ERVFC1-1P60608 527 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 DSC1Q08554 894 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 C2orf27AQ580R0 203 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF738Q8NE65 137 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 RELTQ969Z4 430 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 GPR137Q96N19 417 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 CSF3RQ99062 836 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 VCX2Q9H322 139 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.89□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF98A6NK75 572 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PRAMEF4O60810 478 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 BMI1P35226 326 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 CLDN17P56750 224 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ERVS71-1P61550 626 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 HTRA3P83110 453 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 NR0B2Q15466 257 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 OR2A2Q6IF42 318 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 OR4A47Q6IF82 309 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 APCDD1Q8J025 514 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 MCHR2Q969V1 340 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 TPPP3Q9BW30 176 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 OR51M1Q9H341 326 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 KLF15Q9UIH9 416 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 GABRQQ9UN88 632 aa6.88□□□□□ -1.31
MEIS1-209ENST00000488550 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms