RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484483.1

PTP4A2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 2

Gene PTP4A2, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-205	ENST00000484483	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483		B9A039	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483		H3BNX3	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RER1	O15258	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SGCE	O43556	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GPANK1	O95872	356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GAA	P10253	952 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	COX5B	P10606	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF823	P16415	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF23	P17027	643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CCNO	P22674	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PCSK6	P29122	969 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FMO3	P31513	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PYCR1	P32322	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GRK5	P34947	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GGT2	P36268	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAD52	P43351	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PTH2R	P49190	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	BLVRA	P53004	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CRISP1	P54107	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ATP5J2	P56134	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ESRRG	P62508	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GALK2	Q01415	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CRMP1	Q14194	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAB35	Q15286	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	EFNB3	Q15768	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PERP	Q96FX8	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	DOK1	Q99704	481 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FN3K	Q9H479	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CMC2	Q9NRP2	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SURF4	O15260	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SYNGR3	O43761	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	GPRIN2	O60269	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	LY86	O95711	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SNAP29	O95721	258 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	BAG2	O95816	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	GYPB	P06028	91 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	CLU	P10909	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF3	P17036	446 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SPI1	P17947	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	EPHA2	P29317	976 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	CDKN1A	P38936	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	EVX1	P49640	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SELENOV	P59797	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	ADAM8	P78325	824 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	AQP6	Q13520	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	MEP1B	Q16820	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-205	ENST00000484483	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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