RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470268.1

SF3B1-208, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, human

TSL 2

Gene SF3B1, Length 2,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SF3B1-208	ENST00000470268	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RBP7	Q96R05	134 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268		A8MXE2	369 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268		J3QRE1	110 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RGS10	O43665	173 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SELENOF	O60613	162 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CDC14B	O60729	498 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GLCE	O94923	617 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CRH	P06850	196 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SBK2	P0C263	348 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	B4GALT1	P15291	398 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	LAP3	P28838	519 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CRABP1	P29762	137 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	TGFBR2	P37173	567 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MTNR1A	P48039	350 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CXCR4	P61073	352 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	VBP1	P61758	197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	NCS1	P62166	190 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	HSF2	Q03933	536 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CTF1	Q16619	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268		Q6ZT83	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	DOK3	Q7L591	496 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	RND1	Q92730	232 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	AMELY	Q99218	206 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	POLE	Q07864	2286 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268		A0A1W2PPL8	197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	F2RL2	O00254	374 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SF3B1-208	ENST00000470268	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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