RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 SPARCP09486 303 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 ACSM4P0C7M7 580 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 KITLGP21583 273 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 CRYBB2P43320 205 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM33P57088 247 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 ECH1Q13011 328 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 SPRNQ5BIV9 151 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 NAA40Q86UY6 237 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 OR5AS1Q8N127 324 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 OR5L1Q8NGL2 311 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 TREM2Q9NZC2 230 aa24.89■■□□□ 1.58
FBXO18-208ENST00000470089 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.572e-8■■■□□ 18.6
FBXO18-208ENST00000470089 WNT9BO14905 357 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ENTPD1P49961 510 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ZMAT1Q5H9K5 638 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 Q6ZR03 302 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 DCXRQ7Z4W1 244 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 TANC2Q9HCD6 1990 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 J3QW42 95 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ADH4P08319 380 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 RAC2P15153 192 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 AVPI1Q5T686 147 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 LINC01590Q5TEZ4 76 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 OR2T2Q6IF00 324 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 FAM166AQ6J272 317 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CLDND2Q8NHS1 167 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ELMOD3Q96FG2 381 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 KIF17Q9P2E2 1029 aa24.87■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 LMX1BO60663 402 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PRSS12P56730 875 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 MVKQ03426 396 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CDK5R2Q13319 367 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 TMEM236Q5W0B7 351 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 FBXW12Q6X9E4 464 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 COLCA1Q6ZS62 124 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PRIMA1Q86XR5 153 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 OR2Z1Q8NG97 314 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 NRBF2Q96F24 287 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 DIRC2Q96SL1 478 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 EGLN1Q9GZT9 426 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 OR51V1Q9H2C8 321 aa24.86■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 JMJD1CQ15652 2540 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 TGFAP01135 160 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 LCATP04180 440 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 TPTEP56180 551 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CDK5Q00535 292 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 HFEQ30201 348 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 HIPK1Q86Z02 1210 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 OR5K1Q8NHB7 308 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CCL17Q92583 94 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 HPS1Q92902 700 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 KCNS2Q9ULS6 477 aa24.85■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 M0R135 149 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 SURF4O15260 269 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PAICSP22234 425 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 DAPP51397 102 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ATP6AP1Q15904 470 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PCK2Q16822 640 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PLBD1Q6P4A8 553 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 SPATC1Q76KD6 591 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF799Q96GE5 643 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CENPMQ9NSP4 180 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 AP4S1Q9Y587 144 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 DYSFO75923 2080 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CLDN25C9JDP6 229 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CIB2O75838 187 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 HMGN1P05114 100 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 CD55P08174 381 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 RBMXP38159 391 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 SLC6A9P48067 706 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 BLVRAP53004 296 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 OR6N2Q8NGY6 317 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 SPTSSAQ969W0 71 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 SLAMF6Q96DU3 332 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 COPS4Q9BT78 406 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-208ENST00000470089 GLCEO94923 617 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO18-208ENST00000470089 IGFBP5P24593 272 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO18-208ENST00000470089 GSTT1P30711 240 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO18-208ENST00000470089 CHRFAM7AQ494W8 412 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO18-208ENST00000470089 TEX30Q5JUR7 227 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO18-208ENST00000470089 FAHD1Q6P587 224 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO18-208ENST00000470089 AMIGO2Q86SJ2 522 aa24.82■■□□□ 1.56
FBXO18-208ENST00000470089 BHLHE23Q8NDY6 225 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.2 ms