RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SURF4O15260 269 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SPRY3O43610 288 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 GLCEO94923 617 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV1-46P01743 117 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ADH4P08319 380 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 KITLGP21583 273 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 COL8A2P25067 703 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS27P42677 84 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CRISP1P54107 249 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM33P57088 247 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM255AQ5JRV8 349 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TEX30Q5JUR7 227 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CYB5R2Q6BCY4 276 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXW12Q6X9E4 464 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 DCXRQ7Z4W1 244 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PARP8Q8N3A8 854 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF511Q8NB15 262 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 HAVCR1Q96D42 359 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ELMOD3Q96FG2 381 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 INTS14Q96SY0 518 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PRRG3Q9BZD7 231 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 OR51V1Q9H2C8 321 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 POFUT1Q9H488 388 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 YAE1D1Q9NRH1 226 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT84Q9NSB2 600 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PTTG3PQ9NZH4 202 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 INAFM1C9JVW0 142 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 M0R135 149 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PRODHO43272 600 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 LCATP04180 440 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TACSTD2P09758 323 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ACSM4P0C7M7 580 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFSF4P23510 183 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 GSTT1P30711 240 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC6A9P48067 706 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 DAPP51397 102 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ESRRGP62508 458 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 MALLQ13021 153 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TAF13Q15543 124 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PCK2Q16822 640 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01590Q5TEZ4 76 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PLBD1Q6P4A8 553 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 USP51Q70EK9 711 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SHFQ7M4L6 423 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 AMIGO2Q86SJ2 522 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 OR6N2Q8NGY6 317 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 LRTOMTQ8WZ04 291 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 YIPF5Q969M3 257 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF799Q96GE5 643 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 COPS4Q9BT78 406 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 HCAR1Q9BXC0 346 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 MSL2Q9HCI7 577 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 A8MV72 311 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF878C9JN71 531 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC14BO60729 498 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SELEP16581 610 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CRYBB2P43320 205 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC15A1P46059 708 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SNAPC1Q16533 368 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 HFEQ30201 348 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 KLHL12Q53G59 568 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 COLCA1Q6ZS62 124 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CPOQ8IVL8 374 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 C10orf67Q8IYJ2 551 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10S1Q8NGN2 331 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 HPS1Q92902 700 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 SLAMF6Q96DU3 332 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 MARCH7Q9H992 704 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPMQ9NSP4 180 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CLDN25C9JDP6 229 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 LILRA1O75019 489 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 RP2O75695 350 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 CD55P08174 381 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ACTR3P61158 418 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS7P62081 194 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 GRB2P62993 217 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms