RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	CMBL	Q96DG6	245 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		15.18	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	C17orf100	A8MU93	164 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902		H3BSA7	217 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902		M0R135	149 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	EI24	O14681	340 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SELENOF	O60613	162 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ACSM4	P0C7M7	580 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TUBG1	P23258	451 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF81	P51508	661 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PSG7	Q13046	419 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SHF	Q7M4L6	423 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	NAA40	Q86UY6	237 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF799	Q96GE5	643 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	POM121	Q96HA1	1249 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SMR3A	Q99954	134 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		15.17	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF878	C9JN71	531 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SPRY3	O43610	288 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	LYNX1	P0DP58	116 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB1	P43366	347 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PRKX	P51817	358 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	CCL8	P80075	99 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PCK2	Q16822	640 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	C12orf73	Q69YU5	71 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TIGD4	Q8IY51	512 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	CBR4	Q8N4T8	237 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	THEM6	Q8WUY1	208 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ABHD6	Q9BV23	337 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	DECR2	Q9NUI1	292 aa		15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902		J3QW42	95 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	HPX	P02790	462 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ALPL	P05186	524 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A16	P16260	332 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A5	P22732	501 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	HSD11B1	P28845	292 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	LIPA	P38571	399 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	SLC15A1	P46059	708 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ALDH3A2	P51648	485 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	RAD23A	P54725	363 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MALL	Q13021	153 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR5AS1	Q8N127	324 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TMEM163	Q8TC26	289 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	ST7L	Q8TDW4	575 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	TEAD3	Q99594	435 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ15	Q99712	375 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MARCH7	Q9H992	704 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	MSL2	Q9HCI7	577 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		15.15	■□□□□ 0.02
USP19-210	ENST00000465902	NDUFS8	O00217	210 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	LYN	P07948	512 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	H2BFM	P0C1H6	154 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	RAC2	P15153	192 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	MMP15	P51511	669 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	GGTLC2	Q14390	218 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		15.14	■□□□□ 0.01
USP19-210	ENST00000465902	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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