RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430081.5

OPTN-208, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 5

Gene OPTN, Length 848 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-208ENST00000430081 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-208ENST00000430081 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.53□□□□□ -1.04
OPTN-208ENST00000430081 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 C22orf46C9J442 243 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 F5H5P2 479 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 H0YL77 283 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 J3QW42 95 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 KRT34O76011 436 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 IFNA14P01570 189 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 SCG5P05408 212 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 IER3P46695 156 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 RGS6P49758 472 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 MAPRE2Q15555 327 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 COQ5Q5HYK3 327 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 Q6ZPA2 131 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 Q6ZSV7 163 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OR2T12Q8NG77 320 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ERGIC1Q969X5 290 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ZNF583Q96ND8 569 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 SAR1AQ9NR31 198 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 RHCGQ9UBD6 479 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 NOTCH1P46531 2555 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 A0A0U1RQK1 487 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OPN1MWP04001 364 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 IFI30P13284 250 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 MMP9P14780 707 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 FUT4P22083 530 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 FPR3P25089 353 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 IFNA8P32881 189 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 KDELR2P33947 212 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 PSMB10P40306 273 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 PMELP40967 661 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 Q6ZTK2 550 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 MRAPQ8TCY5 172 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 SLC7A6Q92536 515 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 RCN3Q96D15 328 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 PRRC1Q96M27 445 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 MRGBPQ9NV56 204 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 GID8Q9NWU2 228 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.51□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OR6C6A6NF89 314 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 H7C1C5 153 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 J3KTA2 159 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 XKRYO14609 159 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 MLNRO43193 412 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 NDUFA2O43678 99 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 TSPAN9O75954 239 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ZNF682O95780 498 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 NPPAP01160 153 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 LOXL3P58215 753 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ARF6P62330 175 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 LCN6P62502 163 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 EGR3Q06889 387 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 ST3GAL3Q11203 375 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 AQP6Q13520 282 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 NRMQ8IXM6 262 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 PDZD9Q8IXQ8 264 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 OR51A7Q8NH64 312 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.5□□□□□ -1.05
OPTN-208ENST00000430081 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.5□□□□□ -1.05
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