RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 NEURL2Q9BR09 285 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 COPS4Q9BT78 406 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A8Q9BY19 250 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 EXD2Q9NVH0 621 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DAPP1Q9UN19 280 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 V9GYQ6 96 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WYN8 130 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0G2JMP0 313 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0G2JPF8 293 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0X1KG70 313 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM247A6NEH6 219 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ANKDD1BA6NHY2 528 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AGAP5A6NIR3 686 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SNTNA6NMZ2 147 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 VSTM5A8MXK1 200 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 MYO1GB0I1T2 1018 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 H0YC42 278 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 hCG_2039718K7EN88 272 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 M0R1B8 84 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 AIREO43918 545 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GADD45GO95257 159 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PTTG1O95997 202 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CSF1P09603 554 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ADRA2CP18825 462 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PGCP20142 388 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GSTM3P21266 225 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GALP22466 123 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CPN2P22792 545 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.572e-6■□□□□ 11.1
PTPRK-211ENST00000429595 OPRL1P41146 370 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CRATP43155 626 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RANBP1P43487 201 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RGS6P49758 472 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PSMD7P51665 324 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 REEP5Q00765 189 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZP4Q12836 540 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMED1Q13445 227 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TIGD6Q17RP2 521 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C12orf73Q69YU5 71 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT13Q86X67 352 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GABRG1Q8N1C3 465 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 WDSUB1Q8N9V3 476 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SETD6Q8TBK2 473 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DOK4Q8TEW6 326 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PIK3R3Q92569 461 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RIT1Q92963 219 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMCO6Q96DC7 493 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SNX22Q96L94 193 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 COQ7Q99807 217 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC32Q9BV29 185 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DSN1Q9H410 356 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CLN6Q9NWW5 311 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 STUB1Q9UNE7 303 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CFL2Q9Y281 166 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 U3KQV3 271 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 J3QLI3 93 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CCRL2O00421 344 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 DHHO43323 396 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PIP5K1CO60331 668 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZIC3O60481 467 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 UPK1BO75841 260 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 LYZL6O75951 148 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C6orf47O95873 294 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms