RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAC3P60763 192 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIRPAP78324 504 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FABP5Q01469 135 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EGR3Q06889 387 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MELKQ14680 651 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST3H3Q16695 136 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF404Q494X3 552 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GGNQ86UU5 652 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KDM8Q8N371 416 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OTOSQ8NHW6 89 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEUROG1Q92886 237 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WNT2BQ93097 391 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PELI1Q96FA3 418 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADGRG7Q96K78 797 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCTD7Q96MP8 289 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INTS14Q96SY0 518 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0J9YW62 118 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM89A2RUT3 159 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRR32B1ATL7 298 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABRPO00591 440 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABHD16AO95870 558 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHG1P01857 330 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TACSTD2P09758 323 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGA4P0DJD7 388 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGA3P0DJD8 388 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOX6P35712 828 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BMXP51813 675 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BIDP55957 195 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ROM1Q03395 351 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLO1Q04760 184 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDK5R1Q15078 307 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TP53I3Q53FA7 332 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THEM4Q5T1C6 240 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM225Q6GV28 225 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FDX2Q6P4F2 183 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNX33Q8WV41 574 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 S100ZQ8WXG8 99 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM203Q969S6 136 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXW5Q969U6 566 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMIM19Q96E16 107 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TXNDC15Q96J42 360 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED29Q9NX70 200 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.3□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED12LQ86YW9 2145 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TVP23AA6NH52 213 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAMP1O60894 148 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UPK3AO75631 287 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AQP8O94778 261 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TGM6O95932 706 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OPN1LWP04000 364 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF43P17038 809 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GZMKP49863 264 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ENTPD1P49961 510 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RORCP51449 518 aa8.29□□□□□ -1.08
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms