RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 TAF10Q12962 218 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CHST9Q7L1S5 443 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GNRHR2Q96P88 292 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SGPP1Q9BX95 441 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 LUZP4Q9P127 313 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TRPM7Q96QT4 1865 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CEP350Q5VT06 3117 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SYT7O43581 403 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 RCBTB2O95199 551 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DPEP1P16444 411 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 FCGR2CP31995 323 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF558Q96NG5 402 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CDC6Q99741 560 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 P2RX6O15547 441 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GPRIN2O60269 458 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 AKT2P31751 481 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 IQCJQ1A5X6 159 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 Q499Y3 187 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ULK3Q6PHR2 472 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF573Q86YE8 665 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GPX8Q8TED1 209 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DOK4Q8TEW6 326 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.61□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 M0QZK8 103 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ITGB1BP1O14713 200 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR5H8P0DN80 308 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 EPHA1P21709 976 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SLC37A1P57057 533 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 RAB11BQ15907 218 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GXYLT1Q4G148 440 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OTPQ5XKR4 325 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF429Q86V71 674 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CMKLR1Q99788 373 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 METTL12A8MUP2 240 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 M0QZQ0 153 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CST4P01036 141 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR2T7P0C7T2 308 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 WNT5AP41221 380 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 RAB7AP51149 207 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 FUT5Q11128 374 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 NECAP1Q8NC96 275 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR2T27Q8NH04 317 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TP53RKQ96S44 253 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PRRT1Q99946 306 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GLRX2Q9NS18 164 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TRAPPC6AO75865 159 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 MMP3P08254 477 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 FUT3P21217 361 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CCKBRP32239 447 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 CACUL1Q86Y37 369 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 OR1P1Q8NH06 330 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 SCAMP4Q969E2 229 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 YPEL4Q96NS1 127 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 PDE7BQ9NP56 450 aa8.6□□□□□ -1.03
TMOD1-203ENST00000395211 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms