RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SIX6O95475 246 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ACTL6AO96019 429 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IGF2P01344 180 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MMP10P09238 476 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 QDPRP09417 244 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NR2F1P10589 423 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IRF1P10914 325 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A4P12235 298 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CD1DP15813 335 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-GP17693 338 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GPX2P18283 190 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ELK1P19419 428 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TBXA2RP21731 343 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 NMBRP28336 390 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CD1CP29017 333 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ADRA1AP35348 466 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CCR5P51681 352 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CCR6P51684 374 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TDGF1P3P51864 188 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 NAAAQ02083 359 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 LCP2Q13094 533 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 BIKQ13323 160 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SCARB2Q14108 478 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 VEZF1Q14119 521 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SHHQ15465 462 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MESTQ5EB52 335 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 EOGTQ5NDL2 527 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HBMQ6B0K9 141 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf88Q6PI97 169 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SCIMPQ6UWF3 145 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM207Q6UWW9 146 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PARGQ86W56 976 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 EID2Q8N6I1 236 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 OR6J1Q8NGC5 347 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR10A6Q8NH74 314 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 MED8Q96G25 268 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C12orf42Q96LP6 360 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PPM1MQ96MI6 270 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ABHD1Q96SE0 405 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF382Q96SR6 550 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 PCGF1Q9BSM1 259 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 CA10Q9NS85 328 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-202ENST00000367364 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 V9GYQ6 96 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.01□□□□□ -1.93
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